mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATGCTTCTGTCATCA GATGCTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGACATGCAAGACCCATTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTT CTCTTTTTATATACATATTTCCTAGTCTAGCTAATTCCCTTTGTTGATCTGTTTCTCTAGATTATATATGCTAGCTTGTTGTTAGCAAGAGGCAAAGGAGGCATGTGGTGATGCTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGACATGCAAGACCCATTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTCAGCCTCTTGCTGAATCCACCTTAATTAGTTCTCGAATGATCCCCTTTTTTTTTTTTATGAAAGTTCTCTAATGATTTCACCATGCTAATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGACTACCTCGAGAAAGACTTTGATGGAATGCTGGAGCAGTAGTTTCAGAGATTTGCTTTGTTTTGGCTCCTATTTGGTTTTCCATGTCAACCGCTTGTAACTGGGTATCATGTTCAGCTTTAGCTATCGTGCAAGTTTCTGATACAACGACAATCTCAAGTTACTGAGGCTAACCCCTCGCCAGCAACATATTTCCAGACCCGATATTAATTTCCAATCTACTACTAC 1 1 5' arm Elaeis_guineensis mirnest 100 vvi-MIR156i 4e-28 -44.4 .....((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((((((......)))))).))).)).)))))))))))))).))))))))).)).... (-44.4)