mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACAAATCGCAGTCTGCCAT GGAAGACTAGTGATTTTGTTGTT TAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACAACATTGACAACAAATCGCAGTCTGCCATATGGCACA AGGTGGTCAAAGAATCAAACAGATCCGCCACGAATCTGGTGCATCCATCAAAATTGATGAGCCATTGGAAGGATCAGATGACAGAATAATAACCATCACTGGCACTCAAGATCAGATTCAGAATGCACAATTTTTGCTTCAGAACAGGCAAGTAGAAAGCCTCAACTTTATACATATTTAAAATTAAGCATCTTTTTGTGTTTTCCTAATGACTGTCCTGTTTTTTCTGTCTTAATGTTTCCGTTTTTAGATATTCTCTTGTTTTTCTTCCCTTTGTGTTTCTTACTAAACCAGAAGATCCACTTTTATACTAATTCTGCTTGAAGGAAAATAACATCTTGGTTCTTTCTATTGTGAAACAGCTGCAAAAGTATAGTAAACATTACTGAGCCTGTAGATCTTAAATATAACTAGAAGAAGTCAGTGGATGTTGGTTTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACAACATTGACAACAAATCGCAGTCTGCCATATGGCACAGACCATGCCTCTACAGGACAAGTTGAAATGGGTATTGAATTTGTACCATAATGCAGCGTTTTCACACTTCCTACCCATTTTCTAACCACTTTTAACTTTTCTTAAACTGCTTAACCTTATGCATGTTAATTTCTTTTCACATTGTACTAATAACTAAACCTAATCTGCTAGTTCTTT 1 2 3' arm Xenopus_tropicalis mirnest mir-7 6e-30 xtr-mir-7-1 9e-41 -27 ..((.((((((((.(((((.(((((((.((((((................)))))))))))))))))).)))))))).)). (-27)