mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCTCAGTTCAGCAGGAACA TGCCTACTGAACTGATATCAGT CTGTCCTCTTGTGCCTACTGAACTGATATCAGTTCTATTTCACACACTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGAGTCGG CTTGTTCTCATCCCAGCAGTTATCATGTGCCTCTAATAGAATTTATTTAGAATGTTCTTCCAAAAGGAACTGAATAAACACTTAAGTGATTTTACCTCAAATAAATAAATTAATAAATGAAGGATCCTTTAAAGCTCTGCAACCTTGTCAGATTTAATGGTAACTGACATGTAAGAAATGATTGCAATAAAGCAAAACCATTCTGGTCCATGGGGGAACTTCAGTAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAAATATATATATATATATATATATAATAAATATATATATATATATACAATACATTATATATATATGTTGATGTATTTGTTTTTTAAGCATGTATTTTGCGTATGTATATAGAGAAACACAACTTTCTAATAGGTTCTCAGATTGGTACGTTATTCAATATGGCTGGACCTGCAGCTGTTCTACACCTACGATGGACCTGTCCTCTTGTGCCTACTGAACTGATATCAGTTCTATTTCACACACTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGAGTCGGGCCCTTGAGCAAAGCGCAACTTTCCCAGAATACACAGAAGTACCCACCAAGGGGCACAGTACTGCGTGAATATTTGTCTTCAGGGCTGTTTAGCATTAGCCATCGGAATGAGAATGCTGCGGTGCCGTCACTGAAAGTACAGGCCAGCAATTACAGTTGTTAAATGGAACTTTTTTTTACATCCATGAAGTAAATGTTTCTGCATGAAGTGTTTGAATAGCACAATAAACATAATGATGTAAATGCCTGTAATTTCCACATGTGTTTTTTGTGCAGTGTGGGCTCACTACCATTGTGTATGGTTTGTGTATTTGTCTCAAGTTTTTATATAACACGGTTTTATTTTACATCTTTCTAACATACATTGTGTTTGTCCATTCCACTATGATTATATTAAAAATCTTCTTTAANCGG 3 1 3' arm Xenopus_tropicalis mirnest mir-24 1e-18 xtr-mir-24a 2e-32 -28.8 (((..(((((((.(((.(((((((((..(((((............))))).))))))))).))).))))))).))) (-28.8)