mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCACA TTTTTTTTTTTTTTTAGG TTTACAGCGGGCCCNCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGTCTCAAAAACAAAGATCAAGAGCCACTTTTGTTTTTCCCAGCAAAACAATGATCAAGAACCATTTGGTTTTTCTCCTAGCAAAACACAAGATCAGGAGGTATCCACCTGAAGGATATTCGTAAGTAGTTTTTTGAACCAAAGCTGTTAAAGGTGTTCATACAAACCAGATGGTAAGTTGGCACCTAAAGTGACCAGTGCATCTGCTGAGTGGAAGAGTCATAAGCCCTGGAGTGCTCGAGTTCCATGTATTGCCTTCCACTCTGTTGGGGCAACTCGCCCCCACCTGAGAACTGGCTATTAATAGGCTGTGAAATTTGACCAAGACCAAGATCAGGTGGCATCTCCTGCGAACTGCTACTACCTTCATTGCCCTTGAAATCCCACGAGGTGCTTGGGAAGTGATTGATAGCTGCACTATGAGGAGCTGTGGGTTGCGCCATGGATGCCCCTTCAGGATTCATGAAGCTGTTTGCTCCAAGACCAGATGCTCGATTCCTGGAGCTCCATGGCTGATTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTTGAGTCGGAGGCCCCTGTGAAACATT TTTACAGCGGGCCCNCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGTCTCAAAAACAAAGATCAAGAGCCACTTTTGTTTTTCCCAGCAAAACAATGATCAAGAACCATTTGGTTTTTCTCCTAGCAAAACACAAGATCAGGAGGTATCCACCTGAAGGATATTCGTAAGTAGTTTTTTGAACCAAAGCTGTTAAAGGTGTTCATACAAACCAGATGGTAAGTTGGCACCTAAAGTGACCAGTGCATCTGCTGAGTGGAAGAGTCATAAGCCCTGGAGTGCTCGAGTTCCATGTATTGCCTTCCACTCTGTTGGGGCAACTCGCCCCCACCTGAGAACTGGCTATTAATAGGCTGTGAAATTTGACCAAGACCAAGATCAGGTGGCATCTCCTGCGAACTGCTACTACCTTCATTGCCCTTGAAATCCCACGAGGTGCTTGGGAAGTGATTGATAGCTGCACTATGAGGAGCTGTGGGTTGCGCCATGGATGCCCCTTCAGGATTCATGAAGCTGTTTGCTCCAAGACCAGATGCTCGATTCCTGGAGCTCCATGGCTGATTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTTGAGTCGGAGGCCCCTGTGAAACATTCTCCTGAAGGAATTCCAGGACCATGAAAGCTGGTCCCGCCTGCTGAACCTTGCAGAAAGAGAGGATTCTCAGAGTTGCTCTGCCATGGATGTGGAAGAAACCTTCCCATCGCAGTGGTTTGATTTCCAGGTACCCGATCAGATGCTCTTGTAGTGGGCAAGTATCCCTCTCGGGATGCCTTGGGTATGCAGCAAAGTCATCAGAAAGCCTNCTCCCCACCTGCTGCTGTTTTCAAAAATGAATGAAAGAAGTCCGCCATAGCGTGAGGACAATAAGAATCCAGGGGGTGGCTTCCTGCAACGCTAATTATGACCAGCCAGCGCCTAACAAAAATTCGTTTTTCTTGGCCAATTCGGGCAACTGAATGATTCCGCTACCTGGTGGGCAAACCTTCGGCTCAGGGCCGGAAAAAAGACCGTGGGAAATTCCAAGGCTACCACCAACTTTATGGCCTGAAAAAAAACTTTTGGCACCCCTCAATTTACTTTCCCCCGTGGCAAATCCCTGCACCCGGGGAATCCCTAATTCTAAGCGCCGCCC 4 0 3' arm Vitis_vinifera mirnest 100 bdi-MIR156 0.0000000000001 -165.2 (((((((.((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((...(((((((((............)))))))))((((((((...((((((..(((((((....)))))))....(((((...........((((((((..((((((((.......((.....(((..(((((......((((((((.(((((((...((..(((....)))..)).)))))))...(((.(((((...((....(((((((((.((.(((.....((((((......))))))..))).))))))))))).((.(((((.....))))).))..))..))))).)))))))).))).))))).))).....))......)))))))).)))))))).....)))))......)))))).(((((........)))))))).))))).((((((.((((((.((...))...)))))).))))))((((((((.((...(((((((.((....(((.(((((.((...)).)))))))).)).))))))))))))))))).))))))).)))))))))))))...))))))))..)..))))))))))))..... (-165.2)