mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCGAGGAGCCAAGCATA AAGAAGAGGTGAGATGAGTTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTGGCTTAGAAACTAATCTATCAATAGATTAGCTACGGCGGGTGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATACTCTCGCTCTTTCTCCTC TGTTGGCTGAAAAAAATGGGATGGAAGAAGAGGTGAGATGAGTTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTGGCTTAGAAACTAATCTATCAATAGATTAGCTACGGCGGGTGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATACTCTCGCTCTTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTGAGTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTATCATGTCATGGGTTTCATGGAATGCTAAAAGATGGGTTAAACTTGATGCTTTTGGTTTTTTTGAGGATAACTAATCTTTGTATGATGTTTTGCAGCTTTAGAAGTGATATGGATTCCACAGCTTATCAAAGCAAAAGAAGAAAAGGTTTTGGCTACAAGAATCTTTCCCCTTGTTGTTCTTCTATTCTGTAGGGGATCTATGTCTCCATGCTTGTGATTTTAGCTTAAGAAAAATGATTATCATTTACTATCTCTGGCTGGTATGTGAATTTCGAGTACAATGACTCGTACATTGAGATATCGTTGTAGAGATGTGAGGTTTGATTGGTGCAATACATCATTGCCTAATATTCTCTTGGT 2 0 5' arm Elaeis_guineensis mirnest mir-160 7e-40 ptc-MIR160d 0.0000000004 -57.3 ..((.((((.(((..((((.((((.(((((((.(((((((((((.((((((...((((((((....))))))))))).))).))))))))))).))))))).))))))))...)))..)))).)) (-57.3)