mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTCCCTAAATATAGGGC TCTATACAAAAGGACGGAGGG CGTACATACCCCTCCGTCCCTAAATATAGGGCCTTTTAACATTCAAATACAGAAATAGTCAATGTGTTAAAGACTACCATACCCTTCATTTTTACCTCAACCCATCACTCTACCAACCCTCCCACTTACCATAAAGTTTGTCTCATCCTCAAAACTACCTATATTTAGGGAAAAGTTCAAACTTCTAAAAGGCTCTATACAAAAGGACGGAGGGAGTAATCA AGAGATCGTTATTACGGGAACGTATAGTACGTACATACCCCTCCGTCCCTAAATATAGGGCCTTTTAACATTCAAATACAGAAATAGTCAATGTGTTAAAGACTACCATACCCTTCATTTTTACCTCAACCCATCACTCTACCAACCCTCCCACTTACCATAAAGTTTGTCTCATCCTCAAAACTACCTATATTTAGGGAAAAGTTCAAACTTCTAAAAGGCTCTATACAAAAGGACGGAGGGAGTAATCACTATTAGCTACTCCATCAATTTCGTGCATATATGTCCATAATATTACGTACAAGCCAAGACAATCAAATTGTAACTATAGCATAAATCCACTAGAATTATGTGCNT 5 0 5' arm Eragrostis_curvula mirnest 100 100 -44.349 ......(((((((((((((.....((((((((((((((...(((.......))).(((((...........)))))..((..................................................)).(((((((.((..((((.(((..........))).))))..))..))))))).)))))))))))))).....)))))))))).))).... (-44.349)