mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGTGTGAACATGTACCT GTACATGTGTGTGCATGTGTA GATTAGCGTGGTCGCGGCCGAGGTACATGTGTGTGCATGTGTATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTATGTGTGTGAACATGTACCTGCCCGGGCGGCCGCTCGAA GANNNNNGGGGCNNNCTGTANACTCAAGCTATGNATCAACGCGTTGGGAGCTCTCCCATATGGTCGACCTGCAGGCGGCCGCACTANTGATTAGCGTGGTCGCGGCCGAGGTACATGTGTGTGCATGTGTATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTATGTGTGTGAACATGTACCTGCCCGGGCGGCCGCTCGAACCCTATGTAGCGTGGTCGCGGCCGAGGTACTTATAGTGNTGATGCCCAAANCTTGNAAAAAAGAGGTCTTCTNGGGCCCCANACCGGTNTTNTGAGCANGTACCTGCCCGGGCGGCCGCTCGAGCCCTATAATGAGTCGTATNAGAATCCCGCGGANNATCGCGGGCCGNGAGCATNCGAAGTCNGG 1 0 3' arm Rattus_norvegicus mirnest 100 tae-MIR1120 0.0003 -37 .......(((((((((((..((((((((((.(((((((((((((((((....)))))))....)))))))))).)))))))))))))...))))))))..... (-37)