mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACAGCAAGTGTAGACAGGCA CCTGTCTGTGCCTGCTGTACA AGGCTGGGTTGTCATGTGACTGCCTGTCTGTGCCTGCTGTACAGGTGAGCGGATGTTCTGCACAGCAAGTGTAGACAGGCAGACACATGACAACTCTGTC TTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTCAGAAACTGGCTTTATTAGGTTTCATAGGCACCACTCCCTTTACTTGGGGGGTAGGTTTTAATATACGAATCAAAATAGAAGGATTACATACGAGTTTATTTTAATAAGCCGACAGAAAAGCCCCAGGCCCCCAAACCCCTCACTGTGGTTGTAGCTCTTGGTGTAGATGCTATGGTGTGAGGGCAGCTTTCTTTCAATGGCTGGTTGTCATTCAGGCTGGGTTGTCATGTGACTGCCTGTCTGTGCCTGCTGTACAGGTGAGCGGATGTTCTGCACAGCAAGTGTAGACAGGCAGACACATGACAACTCTGTCCAGCCAGGCCCTTGGCTCCTTCGTGTTTCCTTTGCTCATGGACAGATACAATCAGCCTGTTTTCCANATTTGGTGATTGGGGGGGGGGGGGATA 2 0 3' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-214 2e-48 age-mir-214 5e-52 -53.7 .(((.(((((((((((((.((((((((((((((.((((((.((((...((....)))))).)))))).)))))))))))))).))))))))))))).))) (-53.7)