mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTCTGTCCCAAATT TTTGGGACGGAGGGAGTATGA ATGTACAACATTGTTTATTTGATACTCCCTCTGTCCCAAATTATAAGTACCTTATTCCATTTTAGATTGTCCCAAAATATATGTCGCTTTTGACTTTTCAACACATATTAATTAAGTTAAATGGTTCATTTGTCTATACTATCCTTGCTTTAAGATTAGAGTAATTATTCTAATGAAAAGTTAGACATTGTAATTAGTATTAAATAGGGGTAAATTAGAAAATAGAATTAGTAGACAAACAATAAATGATGTTTCCTTAATAAATAGAATATTCTAAAAGGTACTTATAATTTGGGACGGAGGGAGTATGAACAAACAGTATCTTTATT GGGGTACACCGCCACTCTTGGATAGAAGGCTTATTAACTTTTTGTTATAACTGGTTTGTGGTAGGTTATTATTAGCTCCTTGCAAAGTAAACTTAATTTGTAGCCAAGGATTGTAATCGGGTTTTCTATGTACAACATTGTTTATTTGATACTCCCTCTGTCCCAAATTATAAGTACCTTATTCCATTTTAGATTGTCCCAAAATATATGTCGCTTTTGACTTTTCAACACATATTAATTAAGTTAAATGGTTCATTTGTCTATACTATCCTTGCTTTAAGATTAGAGTAATTATTCTAATGAAAAGTTAGACATTGTAATTAGTATTAAATAGGGGTAAATTAGAAAATAGAATTAGTAGACAAACAATAAATGATGTTTCCTTAATAAATAGAATATTCTAAAAGGTACTTATAATTTGGGACGGAGGGAGTATGAACAAACAGTATCTTTATTGATTCAAAAGAAGTTCACTGATAACAAGCGATCCAAGTTTTGTTACTTGAGCAATATTCATATTTCATACACATCTTTCCCATACTATTTGGAGATATAGTTATATGGATGTGCAAGTTTTGTGTAACTTTAATGCTATCAAGACACACAGCCTTTCCTAGAAATACTGAAATTGTGTATTATATCTAAATCATCTAAAGACTATAATCAGTTAAGAGACTTCATGATGTAAAAAATGACGGATAATTGAAAAGATGCCACTATCATGTTAGTTCAAGAGAACAAATTCAATAAGAG 0 0 5' arm Aquilegia_formosa_x_Aquilegia_pubescens mirnest MIR1122 0.000005 100 -83.2 .........(((((((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((.((((..(((....(((.((..(((((((((((.................)))))))).((((((..((((((..........(((((...((((((((....))))))))..))))))))))).)).)))))))..)).))).)))..))))..))))).)))(((.(((..(((((........)))))..))).))).((((....)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))......... (-83.2)