mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTTGGCAAGTTGTTCTTGGC CAAGGATGACTTGCCGACTCT GCGTGTAGGTGTCGAAAGCATGTTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACTCTCTTTCTTCCTATTTATTTGGATTGGATCTATCTCCGTGTATGTTAAATTAATGGAAATAATGAAGTTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATGCTTCTTTCCGCTCCACATGCCA TGCGTGTAGGTGTCGAAAGCATGTTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACTCTCTTTCTTCCTATTTATTTGGATTGGATCTATCTCCGTGTATGTTAAATTAATGGAAATAATGAAGTTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATGCTTCTTTCCGCTCCACATGCCAGGCCATTGGTGATACTCACGGTCACAGATGAATCACCGGTCTCGAGTTCCGATCCATTTTGGCCCAAGAATGCTCGAGAGGTATGTTATTGTTCGATTCATTTCATGGTTCATTCAGGTTGATTCTGAAAATAGGATGTTTCATCAAGCTACTGCTGCTTTTCTTAGCTCACCCTTGCCCCTTCGATGCACTTGTTTGATCCCTAGCAATTTTGGTTCAAATAAGATTTACCCTTGTCAGTATATATATATATACACCTCTCTTTGTAACTTCACATACACTAGTGTCAAGATCAGTGAAATGAAGACCAAAATCAGAATGAGGAAGAATAGAACATCATGATGTAAGTCGATTATTCCTTGCAACATAGGTGTTGCTGCATCTTGAGGCTGAGAAGATGTCCTGATCGCATCTCTCTCAAGCCATTGTCTAAGGGCTTCATATTCCTCTGGAGGGTAAGATACCAAGCAAAACCCCCATCTGACGCTACTTGTTTGATAAAGGAATACCTTTTGTCTGAACTACCTTGATACAATAAGTCGCAAAATTCATCAATC 0 0 3' arm Eucalyptus_globulus mirnest MIR169_2 0.00000001 vvi-MIR169g 0.0000000005 -61.1 ((((((.((.((.((((((((((.....((((((((((((((((((((((.((.((.((.(((((.((((((..((((......))))......)))))).))))).)).)).)))))))))))))))))))))))))))))))...))).)).)))))))).. (-61.1)