mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTATTACTTTTGGTACGCG CGTACCGTGAGTAATAATGCG GTGTCTTTGCCGGTGACAGCACATTATTACTTTTGGTACGCGCTGTGACACTTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCGTGGTCAACAGCGCAGCAC GGCCCCACCCTGACTCTGGCAGCCTGGAGCCGTGTCTTTGCCGGTGACAGCACATTATTACTTTTGGTACGCGCTGTGACACTTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCGTGGTCAACAGCGCAGCACCGGGAGTGCATCGGACCTGGGAGTGGACAGCGTGGTGAGAGAGGAGGTGTACAAGCTGCAGGCCCGGGTTGATGTATTAGAACAGAAACTGCAGCTGGTGCTGGCCCCACTGCACAGCCTGGCCTCTCGGTCCCCGGAGCATGGGCTGCAAGATCCTGGCAGCCTGCTGGCCCACTCCTTCCAGCAGCTGGACCGGATTGACTCACTGAGCGAGCAGGTCTCCTTCCTGGAGGAACAGCTGGGGTCCTGCTCTTGCAAAAAAGACCTGTGATGGCTTCTCAGTGCCCATGTTGGATTGAGCTGTTACCCCTACGTCCCTTCTAGCCTGAGTTCAAGTGCTGTCCGGTGGTGCCTGTGAG 3 0 5' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-126 4e-28 rno-mir-3567 8e-51 -33.9 (((.((.(((...((((.((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)).))))...))).))))) (-33.9)