mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAACACTTCTGCACAAAC GTGTGCGGAAATGCTTCTGCT AAGAACACTCTATGAATCTAGTGGAAACACTTCTGCACAAACTCGATTTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTTTAGGGTTTGCC CGGGGGACACCCTCTGGCCGCAGCCGCCTCAGATTTGGAATTCTACACTAAAGTCATCATGGGCATTTTCCAGAGATTGATGAAAAATAAGGAACTCATTCCTTTGGCGTTTTTTATAAGCGCGGCAGCCACTGGAGCCTCATCTTTTGCTTTGTATGCTTTGAAAAAAACCGACGTGGTTATTGATCGAAAAAGAAACCCAGAACCTTGGGAAACGGTGGATCCTACTCAACCCCAAAAGCTTTTAACCATCAACCAGGAATGGAAGCCTGTTGAGGAGCTGCAGAGAGTCCGGAGAGCGACCAGATGATTACTCGCTGCTCCTTTCTTCCAAAGAACACTCTATGAATCTAGTGGAAACACTTCTGCACAAACTCGATTTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTTTAGGGTTTGCCTGCATTCTTTGGATCCTGCATAAGCAAGCGAAGGTAGCACATAGTCTAAAATGGTTTTTCGTGTTTATTGGTGTAAATTTCAATTTTACAGTTGAAATTTTATGTTTGTGATGGTTGGATATTTTCCTTGAAATGTATAAACATGTAAAAATTAGATTACTGCCTGTAATAAATAATTAGATGGCTATCTGTAAAACGTATGACCTGTGCAAAGATATCAAAATTACTTACTTTAAAGTGGAGGGGCATCTTTTATGGGAACAGCCATTTTGAGTATAAACTTCACTTTTAAATCAGTGCTATTCTGAGTTATTNCAGTCATCCTCTCCCAGAACTCTGACATGATGTT 5 0 5' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-147 7e-30 rno-mir-147 2e-39 -33.5 ......((((((.((((.((((((((.((.(((((((((...(((....)))......))))))))).)).)))))))).)))).))))))..... (-33.5)