mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATTTTATGTATGAGCTGGT TTGCTCATAAAAGTACAGTAGCA ACTAGAGCAGTCAGAAATGAACTTGCTCATAAAAGTACAGTAGCAGTGAGCAGTAAGTCTGTAATTTTATGTATGAGCTGGTTTCTGACTAAAACGCGCAG TCTCTCAGGAGCGTTCAACCTAGACAGGCTTTTAGTTCCTCCCAAAAAGTCTCCATGCTAAGCCTCAGGGCTGGGCAGAGAAGTCAGGCCCCTCCTTTTGCTCTCCTCTGAGCCTGTTGCTGGGGCTATAGCCAGGACAACTCTTAGGTTTGTATACAGTACAGAAAGAGATAGCAGTGATTTTGGAAATAACTTAGAGGCTCCAGAGCTGCCGAGGAAACCTCTCCGGTATGGGTCCTGGTGGCCAGTGTTTCTCTCTCTTGAAGGGCATGGAGCTCTGCTTCTTCACTTCAGGGTAAGATAGGTTGATCAGAGGATGTCTGCATCAGTAGGGATGAGAGGCACAGACTAGAGCAGTCAGAAATGAACTTGCTCATAAAAGTACAGTAGCAGTGAGCAGTAAGTCTGTAATTTTATGTATGAGCTGGTTTCTGACTAAAACGCGCAGCATATGTCTCAGCCAGCCCGGCAAGGAAGCAGCTCCTGAGGGGAAGCAGCTCCATAGGGCCTCAGGTCCTGGAGAGACCTAATTCTAGGGCCAGAGCCTTTCCCAGTTGCCTTGTTTCAGCCAAGAATGCAGTGGGAACCCTTGCCTTACCACTCTTGGGTCCCAGAGGCAGCTGCCAGGGTGATGCCCTCTAAGACACCTGTGGATCTGACTTAAGTATTCTGACAGTGTTCTAAAGGAGTGGGGCCTTTTTCTCTTTTTTAAATAGAGGGGAATACAGTGAAGAGAGGA 4 2 3' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-590 6e-49 mml-mir-590 0.00000008 -26.1 ........((((((((....(((.(((((((...(((.(((.((((...((.....)))))).))).))).))))))).)))))))))))........... (-26.1)