mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGCTGTGCTGGGCTGGGCTG GTCACAGATGGCACTGCTGGT GGCCGAATTCAAAGTCACAGATGGCACTGCTGGTCAATGACAATAACAATGGTCAATAACAAGCTCCAAGTCCGGGGCTGGGCTGTGCTGGGCTGGGCTGGGTTTTAGTC TTTTTTTTTTTTTTCTTGCTGTCATCCCTTCAAACGGTGTGTACTTGGCATGTACATACAACCAAGGGTGAGCCCGCTAAGATGGCTCCTGCTGAACTAAGTGATTCAGCAGAGTACCATTGAGTATAGCCACGTGCAGCAGGAAAGAGGCTCTGAGAACCCAGGCAAAAAAGGTCCTCCAGGAGGCAGAATGGGCCGAATTCAAAGTCACAGATGGCACTGCTGGTCAATGACAATAACAATGGTCAATAACAAGCTCCAAGTCCGGGGCTGGGCTGTGCTGGGCTGGGCTGGGTTTTAGTCTACACCAGATAACTGCCAGGGAGTAAGCCTCGTGCCG 4 2 3' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-692 0.00002 100 -33.9 (((.(((.((..((((.(((.((((((.(((.((...((((..........))))...)).((((((......)))))).))).))))))..))))))).)).))).))) (-33.9)