mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGCAGGCACAGACAGGCAG GCCTGTCTACACTTGCTGTGC AAGGGCCTGGCTGGACAGAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACCCAGCCTGAATGACAACC AAAAAAAATTATGCCTGTTTTTTTTTCCTTAAAATCGTGTGAATTTTCTGTTTTTGACAACCATCCTTGTTAGCAACATTCTGATCACGTGTATGAGTGTACTTCCTGAATAAAGTCAAACGTCTAACTTCTTTTTAGTTCCATAATGTTTTAATGTTTAATTCTATTGTGTGTTTTTCTCCTTTCCCTTTATCCCCCCCCCCCCCAATCACCAAATCTGGAAAACAGGCTGATTGTATCTGTCCATGAGCAAAGGAAACACGAAGGAGCCAAGGGCCTGGCTGGACAGAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACCCAGCCTGAATGACAACCAGCCATTGAAAGAAAGCTGCCCTCACACCATAGCATCTACACCAAGAGCTACAACCACAGTGAGGGGTTTGGGGGCCTGGGGCTTTTCTGTCGGCTTATTAAAATAAACTCGTATGTAATCCTTCTATTTTGATTCGTATATTAAAACCTACCCCCCAAGTAAAGGGAGTGGTGCCTAAGAAACCTAATAAAGCCAGTTTCTGAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAACC 3 0 3' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-214 2e-52 rno-mir-3120 1e-59 -57.4 ........((((((.....(((((((((((.((((((((((...((((((((((((.............))))))))))))...)))))))))).)))))))))))))))))............ (-57.4)