mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCCAAAGGTGAATTTTTTGG AAAGAATTCTCCTTTTGGGCTT ATTTAATTGCTTACAACTTTCCAAAGAATTCTCCTTTTGGGCTTTCTCATTTTATTTTAAGCCCAAAGGTGAATTTTTTGGGAAGTTTGAGCTAAATTCC ATTGGGCTTAGACAGTTTCGGTCCGGATTCCGGGACTGGGAACTGTAGGACTGAGGGTTACAGAACAGCCTTCATAGCCTTCCCAAACATTTAATTGCTTACAACTTTCCAAAGAATTCTCCTTTTGGGCTTTCTCATTTTATTTTAAGCCCAAAGGTGAATTTTTTGGGAAGTTTGAGCTAAATTCCTTCAACTAAATTATGTAAATGAAGATAAATTTGCTTTTTAAATTGCACATTTACTTCCACCTAAAACACGAATGTTACCACTTCATACTTCATAGCACAATTCTAAGCACAAGTCACATTTTAAAGTTGCCATTTTCATTGACTACTTCACACCTTAGTGTTCTTTTTCTGGGCCATGTCCCTCAGTTGTCTGTAGCACCTTACCTGTAAGAAGTTAAGTTCATTGTCTAGGGCAAGCTTTATATAACATGGATTTTCCCGACAAATGGAAGGATCTATTTTCTGACCATAAAGTCACAGAATTAAAGTTTTGATTTCAATGTTTGTATACTTTAAACTGGAACACTATAAGCAATTATAATAATGCTCTGTCTTAATTCGGTAAACCACATTTTAATTAGCAAGGGTAAATATTTAGAATGTTCACATATGAGATGACTGTGTATAAATAGACCGTGTTCATGATTGACCCAGAAGTCTCCTGCTGAGTGAGCAGTAAGTACTCCCTCATGAAGTCCTCATAGTACAACCCTGTGTGCTTTTGGGAACTGGACAGCCTTCCCTTCTGCCTTTAATGAAACGTCTGCTTTGTCTCTCAATCAATGAAGATCCAGCTCCCGGTCCCACAGGGGCTCTTCTTCCCCC 1 1 3' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-186 5e-37 rno-mir-186 1e-43 -37.6 ........(((((.(((((((((((((((((..(((((((((((..............))))))))))).))))))))))))))))))))))........ (-37.6)