mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTCTGTAGACCAGGCTGG ACCCTGGTCTACAGAGTGAGT GAGGATTTCTGAGTTTGAGACCACCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACATAAAGAAACCCTGTCTTGAAGAATAGATAGATAGATAGATAGTTTGTTGGTTGGTTGGTTTGGATTCTCTGTGTAGGCTATCCCAGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAACTCAGAGATACTG TTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTTCTTTTTTCCGGAGCTAGGGTTACAGGTGGTTATAAACAGTCTGATGTAGGTGGCCAGAATTGAACTCAGGTAGCTGTTAGGTGGTGGAGCACACCCTTAATCCCAGGACTTGGGAGGCAGAGACAGGAGGATTTCTGAGTTTGAGACCACCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACATAAAGAAACCCTGTCTTGAAGAATAGATAGATAGATAGATAGTTTGTTGGTTGGTTGGTTTGGATTCTCTGTGTAGGCTATCCCAGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAACTCAGAGATACTGAAGGGACTCCAGCAGGCAAACATGACTCTACCAGGCCTTGCCCTTCCCCTTTCTTCCTAAAACCAAATTACATTCCTAAAGCTAGCCACCATGTCTGTCCTCTTAGTCACTTCCTCCTTCCGAGGCTGACTTCCAAGGCCCAACTGTTAAAATAGG 1 0 3' arm Rattus_norvegicus mirnest mir-1937 0.00000001 mmu-mir-3470b 0.00000000004 -80.8 .((.(((((((((((.(((.(((.(((((((((((((((((((((..(((.((((.....((((((.(((......((((.((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).)))..)).))))))).)))))))))).)))..))))))))))))))))))))).))).)))))))))))))).)). (-80.8)