mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTGGGACGGAGGGAGTATG ATACTCCCTCTGTCCCAAATTA TATGTACAACATTGTTTATTTGATACTCCCTCTGTCCCAAATTATAAGTACCTTATTCCATTTTAGATTGTCCCAAAATATATGTCGCTTTTGACTTTTCAACACATATTAATTAAGTTAAATGGTTCATTTGTCTATACTATCCTTGCTTTAAGATTAGAGTAATTATTCTAATGAAAAGTTAGACATTGTAATTAGTATTAAATAGGGGTAAATTAGAAAATAGAATTAGTAGACAAACAATAAATGATGTTTCCTTAATAAATAGAATATTCTAAAAGGTACTTATAATTTGGGACGGAGGGAGTATGAACAAACAGTATCTTTATT GGGGTACACCGCCACTCTTGGATAGAAGGCTTATTAACTTTTTGTTATAACTGGTTTGTGGTAGGTTATTATTAGCTCCTTGCAAAGTAAACTTAATTTGTAGCCAAGGATTGTAATCGGGTTTTCTATGTACAACATTGTTTATTTGATACTCCCTCTGTCCCAAATTATAAGTACCTTATTCCATTTTAGATTGTCCCAAAATATATGTCGCTTTTGACTTTTCAACACATATTAATTAAGTTAAATGGTTCATTTGTCTATACTATCCTTGCTTTAAGATTAGAGTAATTATTCTAATGAAAAGTTAGACATTGTAATTAGTATTAAATAGGGGTAAATTAGAAAATAGAATTAGTAGACAAACAATAAATGATGTTTCCTTAATAAATAGAATATTCTAAAAGGTACTTATAATTTGGGACGGAGGGAGTATGAACAAACAGTATCTTTATTGATTCAAAAGAAGTTCACTGATAACAAGCGATCCAAGTTTTGTTACTTGAGCAATATTCATATTTCATACACATCTTTCCCATACTATTTGGAGATATAGTTATATGGATGTGCAAGTTTTGTGTAACTTTAATGCTATCAAGACACACAGCCTTTCCTAGAAATACTGAAATTGTGTATTATATCTAAATCATCTAAAGACTATAATCAGTTAAGAGACTTCATGATGTAAAAAATGACGGATAATTGAAAAGATGCCACTATCATGTTAGTTCAAGAGAACAAATTCAATAAGAG 0 1 3' arm Aquilegia_formosa_x_Aquilegia_pubescens mirnest MIR1122 0.000005 100 -83.2 ..........(((((((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((.((((..(((....(((.((..(((((((((((.................)))))))).((((((..((((((..........(((((...((((((((....))))))))..))))))))))).)).)))))))..)).))).)))..))))..))))).)))(((.(((..(((((........)))))..))).))).((((....)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))......... (-83.2)