mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTACAAAGTTGAGACATTT GTGTCTTAACTCTAATACTACT AAATAAGTGTCTTAACTCTAATACTACTTTATATTAAAGTTAGTACAAAGTTGAGACATTTATT ATGGCCGGTCATCGACAATCGCTGGCAGCGGCTTCTCTGAAGCTCCCAGCTCTTCTGCTTCTGTTGATCTTCAGCTTGAACTGGGGGCATGCCGTCGCGCACTTCGATCCTGCAAACATGACGGAACTGCAGAAACATGTCTCCTTTTTCGACCGCAACAAGGATGGCTTCATCACTCCTGTGGAAACCATCCAAGGGTTTGTTGCAATCGGTTGCGAGTATGCATTTGCTACTGCTGCCTCAGCCTCCATTCATGGTGCCCTTGCTCCTCAAACAACCCCGGCTGGTACACCACTGCCTCACTTGACAATATACGTGGAGAATATCCACAAAGCTATGCATGGAAGTGATTCGGGTGTATACGATCCTAAAGGAAGGTTTCTTCCCCAAAAGTTTGAGGAATTATTCAAAACATATGCAATACTCCGACCAGATGCGTTGACACTTGCAGAGATGCATGCGATGCTCTTTGCTAAACGAGATCTAGACCCGATATCATGGGCGCCACCCGAGATAGAGTGGGGGCTATTATTCACGCTTGCAAGCGATTGGCTTGGATTTCTTCACAAGGACAGTGTTAGAGGTATATACGATGGAAGCGTGTTTACCAAGTTGGAGAAGAAATGGCACCCTTCTCAAAGTGATATATGATGAACTTGATGTAATGTGGGACCCACATACAAGCGACGGAGAAGGCCCAATTCGTCCACACCAGGAGTCCATGCCACTGCAAGCAACCACCAAATTTGAAATACGTATTGTATCTCTAGTTACCGTATTTAATACCCCCCTCCATCTCAAAATAAGTGTCTTAACTCTAATACTACTTTATATTAAAGTTAGTACAAAGTTGAGACATTTATTTT 3 1 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.000000000000004 tae-MIR1137 0.00001 -20.6 .((((((((((((((((....((((((((((...))))).)))))...)))))))))))))))) (-20.6)