mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTATAAAGTTGAGTCATCT ATGACCCAATTTCGTACTAAC AACAACATGTACTCCCTCCGGTTCCAAAATAGATGACCCAATTTCGTACTAACTTGGTACTAAAGTTAGTATAAAGTTGAGTCATCTATTTGGGAACAGAGGGAGTATGCTTCACA GGAAAAATTGGGGTCTCTTTCCTCCTTCTTCTTCTTCCTCCTCAAATTATGCCATGGCTATAGTGTACATAGTTATGCGCAAAATAGACGTGTGTTTTTCCCAAGTTTCACAGAGACTTCGCCGGCAGCAAAGCCGCGCGGACAAAACAAACTACAGAAAAGTTTCCCACGAAACGCACCATGGGTAACACAGAGGCACGAACAACATGTACTCCCTCCGGTTCCAAAATAGATGACCCAATTTCGTACTAACTTGGTACTAAAGTTAGTATAAAGTTGAGTCATCTATTTGGGAACAGAGGGAGTATGCTTCACAACCACAACAAAAACACTTATAGAGGGGGTATCTCTGCAGCAGAAGAACCCCTTTCCCAGGAAATCCATTACTTGACTTACACATCTACGAGATGGGACGGCAGAGCCTTTATAACAACCATTAATCCGGAAGCTTCAGGTGATGCCCCATGGCTACAAGTTGACCGCAGACACAAGGGTTAAGAACTCGGGAGCAGATCCTGGATGTCCTTCCCCGAAGCTAAAGGGGAATTGGTTGGCGCGTAAGGCTCAAAAACGCCCCTCTTTGCCCCAAGATTTGGGAAATCCCATAATTAGCCCCAAAAATGTGCTTGGGAGACCTCAAACGTGTTTACGGTTACAATGTACCGTGGCAACCCTGTGAAAAGGGCACGCGCCTAACCGGCCCCACTAGCACTCCCTTATACCGTCCCCCAGTGTTGTGTG 2 0 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 5e-28 tae-MIR1137 0.0000000000004 -53.4 ........((((((((((..(((((.(((((((((((.((((((.((((((((((.......)))))))))).)))))).))))))))))).))))).))))))))))........ (-53.4)