mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCGCAGGTATGGATGTATCTA TATACATTCATTTCTGCGACAATT GTCGGTGCTCGTACGTAGGTACTCCCTCCGTTTCGAATTACTTGTCGCAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTATATACATTCATTTCTGCGACAATTAATTTGGAACGGAAGGAGTATCTTTTAGCCAGGCCTTG TGCGCCGTCATGTAGTCGGTGCTCGTACGTAGGTACTCCCTCCGTTTCGAATTACTTGTCGCAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTATATACATTCATTTCTGCGACAATTAATTTGGAACGGAAGGAGTATCTTTTAGCCAGGCCTTGCTTCAGCTAAGCTTTTACTAGGTATGTATTGTTTTTGGGGGTCGTCTGTATAATTATTTTGCACACGTTGTACTGAATCCACAAAGTGAAATTGTAAATTACTTGCTTATATATATATATTGCCTACGTAGCTAGCTAGCTTGGTACAGTAGTTTGTGATTTTGAACAAGGGGATTCAGTTCCCTGTTTACTGTAACATACTACTATATATTTTAATGAACTTCACATGTATAATTATCCAAAAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 7e-34 tae-MIR1136 3e-39 -63.8 ...(((.((.((....(((((((((.((((((((((((((.((((((((((.((((((((((.((((...((....)))))).)))))))))).)))))))))).)))))))))))))).)))))))))....)).)))))... (-63.8)