mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCGCAGGTATGGATGTATCTA GATACATCCATTTCTGCGACGAGT CTTGTCAATTACTCCCTCCGTTCCGAATTACTTGTCGCAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTAGATACATCCATTTCTGCGACGAGTAATTTGGAACAGAGGGAGTACATGGCAT ACCCGCCCCGTAGATGATTACGCCACGCTATTTATAGTGACACTATAGAATACTCAAGCTATGCATCCAACGCGCTGGGAGCTCTCCTATATGGTCGACCTGCAGGCGGCCGCGCTAGTGATTAGCGTGGTCGCGGCCGAGGTTTTTCTATAAGAGCATGCATTGTACTCCAACCAGAGTTAAAGCGTACAAGTCAGACACTTGTCAATTACTCCCTCCGTTCCGAATTACTTGTCGCAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTAGATACATCCATTTCTGCGACGAGTAATTTGGAACAGAGGGAGTACATGGCATCTACAATGGCGTCGAAAGCTTAATGAAGACAGGAATGTGACTAGGCAAGGGGAAACTAACAAACTGCGGCAAAAACATGCCATTATTTGTCCAATGCTAAGATGTTGACAATACTCCAAAGTGTAGCACACGTGCAGTACCTCAGTCTCACTTCTCAAATGGATTTTGTTGGACCTCACTTTCAGAAGTACCCAACGCCCTTCACTTCACCTATCTTGGGGCCATTGCCATCGTTACCAAGAAACAGGAACCGACCATTTCCTCGAACAGCTATTTCTCTTATGCGTCTAACGAGCCCAGTTATAGGATCGGAGAACCACTTTGTCTCAATATTTCCTTCCAAATAGAGAACAGATCCGGTCTTGACATGCTTCAGCGCGAGGGTACCCAGCCTGTCCGGGTAGATGCGTACGCGGTGGCACTGCACGGAGCTGCGTTCCGGGTACTGGTGCGGCTCCTCGTTTGTCAACGGGCGGCGGTTGTTGCGGATACCGCGGGGCCCAGAGAGACCAGACGAAGGTTTCCACTCCGCAGCCGTTCTGACAGGGTCTTGACC 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 3e-42 tae-MIR1136 7e-49 -74.8 ..(((((..(((((((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((...((....))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).)))))))))..))))). (-74.8)