mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCACAGGTATGGATGTAT ACATCCATTTCTGCGACGAGT CTTCAATTTGTACCCCTCCGTTTCGAATTATTTGTCACAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAATTCTAGATACATCCATTTCTGCGACGAGTAATTTAGAACGGAGGGAGTATATCTAAA CGGAGGCGCCCAGGTTCGCGTGGGGCGCGAGADCAGCTGAGCCGGCCGGAAAGCTGTACGCACCGGTGTTGCTCAACCTGTCCGGCGGCTCCGGCGCGCGANCGTTCATGGCGGCGGTCCAGAAGGATGACGTGGCGGCCGTGGGGCAGCGGTACGCGNCGGACAGCAGCGAGGCGCCGTCCCGTCCATGGTAGCGCAGGATTTGGCTCCCGTGATCGCAATGTTCGCGCTGATGCAAGGCTGTTGTTCTTGTGATAATTTTTCTTCAATTTGTACCCCTCCGTTTCGAATTATTTGTCACAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAATTCTAGATACATCCATTTCTGCGACGAGTAATTTAGAACGGAGGGAGTATATCTAAACAAGTAGTGTATATGCATACCGTTACATTCACAAAACAAACAGAGTTGAGTTTTTCTCATTCCGTTTCCTTTACAGGCGTAATCTGATTCCGTT 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 2e-34 tae-MIR1136 6e-37 -59.3 ........(((((((((((((((.((((((((((((.((((.(((((((((((((((..((...))..))))))))))))))).)))).)))))))))))).)))))))))).)))))...... (-59.3)