mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCGCACGTATGGATGTAT ACATCCATTTCAGCGACAGAGT GTATAAATGTACTCCCAACGTTCCGAATTACTTGTCGCACGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTAGATACATCCATTTCAGCGACAGAGTAATTTGGAACGGAGGTAGTATGTCAAAG TCCTTCCATTGGAGCTGCATTGCATACTGCCACCGCAGAAATGTATCTTTCTGGGCGTTCTGCTTAAAGTGAAGTTGGATCCGTGCATTTGCGGTAATGCTCTTTGGATGGACGATTTGAATGTATAAATGTACTCCCAACGTTCCGAATTACTTGTCGCACGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTAGATACATCCATTTCAGCGACAGAGTAATTTGGAACGGAGGTAGTATGTCAAAGATGTCCAGTCTAGCTATGTACTCCTTTGTTCACAAATAAGATTTTCTAGTAACTTTTTTCTGAGTTGGATGTATATAGACACGTTTTAGTGTGTTTGGTCACTCATTTCAGCCTGTCTGTAGTCCATATTGAAATCTCAAAAACATCTTATGTTTATGAACGGAGGAAAAAAAAAA 4 1 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 1e-38 tae-MIR1136 4e-35 -54.4 ......(((((((.((..((((((((((((((((((((....(((((((((((((((...((....)))))))))))))))))....)))))).))))))))))))))..)).)))))))..... (-54.4)