mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCTCATAATGTAAGA TTACATTATGGGACGGAGTGGT GTCTTATACTCCCTCCGTCTCATAATGTAAGACGTTTTTATAAGCTATGTTAGTCTGTAAAAAAAAGTCTTTGCAAAAACGTCTTACATTATGGGACGGAGTGGTAGTATTTG TTTTTTTAGTCATTGTAAATGTCTTATACTCCCTCCGTCTCATAATGTAAGACGTTTTTATAAGCTATGTTAGTCTGTAAAAAAAAGTCTTTGCAAAAACGTCTTACATTATGGGACGGAGTGGTAGTATTTGCAACGCAAGCTCATATCGATGAATTGTGTCTTATATTCAGCTATCCTTGTTTTCCTTAACATTCCGTAAGTAAGGAAAAGATTGTGACCTTCATATCTCTCTTATACCATACAGAAACAAAATCAACTATTGTAGAACGATACACAACATCCTGAGATGCCATCGGCGTGGGCATATGCTTCGGAGTGAGACCTGCTGCTATCCACAGCCTGGACACTCCTGGAGGGGGCAGACCTGTGCAGCCGTTTGGGTTCTGACTACCGCAGCCCCTCCTATACGGCNATGCACACCGACGATTAGCAGCAGCAGCGCGAGGAGGGCGAGAACCCAACAAGCACAAGCGGCGACANCCGGGTTCACTCCCNGGGGGGGCCNGTACCAATTCCCCTATATGATCTATACCNCGCTCACNGGCGTCGTTTAAACTCTGACGGAAAACCGGGTACCAATAACGCTGAGAATCCCTTCCACGGGTATACAAANGCNACGTTC 0 1 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.000000006 tae-MIR1130 6e-43 -45.1 .....((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((...(((.....))).....)))..))).))))))))))))))))))))))))))).)).)))))... (-45.1)