mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTAGCTCGAGG GGAAGCTAATATCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTAGCTCGAGGCCACTAACATTTAGATCTCTATTTCGATCAAGATCTTCTTTTACTTTTGCAGGGTTTTAAAATAGTTTTTATTTGATAGAGAGATCAATATATTAGGGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGGTGCTTCCTCA GACTCTCACAAGTCACAAATCAGTCTCTTCTTCTTCCTCTCGCAGAGTCAGTCACTCCTCAAGACTGAAATAGAGAGAGTAGAAGGGGAAGCTAATATCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTAGCTCGAGGCCACTAACATTTAGATCTCTATTTCGATCAAGATCTTCTTTTACTTTTGCAGGGTTTTAAAATAGTTTTTATTTGATAGAGAGATCAATATATTAGGGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGGTGCTTCCTCATGATTATCTTGAATCATGTCCACATATGGCTTTGATCTGAAAGCTCAGAAGGTACATATCATTAGTTCTGTATAAAATAAATGTATAATGATGGACATGAATGATGTGATGGATAGCAGTGACCAATACAGATATTTGCTTGGACCAGCTTGTTCTTGTTCTGGTACATGACCACTCCATTGTTTATATCTATACAAATATGCATATCAAAAGTTTACATGAGAAATAAACAAGAAGTTTTTG 5 0 3' arm Euonymus_alatus mirnest mir-166 0.000000003 ctr-MIR166 0.0000000000006 -51.6 ((((((...((....(((.((((((((..((((...((((..((.((((.((...(((((((...((((..((((.((..(((.((((.....))))...)))..)).))))..))))...)))))))...)).))))))...))))...))))..)))))))).))).))..))))))... (-51.6)