mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTATGGAACGGAGGGAGTA CTCGCTCTGTCCCATAATATA GATAAATAACTACTCGCTCTGTCCCATAATATAAGAACGTTTTTTACAGTAGTGTAGTGCCAAAAACGCTCTTATATTATGGAACGGAGGGAGTAGTGGTAATG TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCCATAATAACGTTAATTGAAGCAAGACATTACACGGGTCGTAGAAGCTATCTAGGAAGCCAAAAAAAAGGGAGAAAGAATTCAATCTCCAAACTGAGACTAACTACATCTGAAGCTCCTACGTACTAGAGCTGCTGCTGCTACCTTAATATAAACTAGTCGCAATTCGTTTATGAGAAAAGGAATTATTGGCTTCAGCTGGATAAGCGAACGTGGATGAGGAACTTCGAGATAAATAACTACTCGCTCTGTCCCATAATATAAGAACGTTTTTTACAGTAGTGTAGTGCCAAAAACGCTCTTATATTATGGAACGGAGGGAGTAGTGGTAATGCCTACTAGACGAGCGAGCGAGCAAATAATGGATGGATGATGTATGTGTTTCATTGGAGGTGCTTCCCGCAGAAGAGGCAGTAGCAGGCGCCCTTGATGCCGCCCCTGATGCACTTGCGCTCCTGCAGACGGGT 2 0 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 7e-27 tae-MIR1120 0.0000000000003 -39.5 .....((.(((((((.((((((.(((((((((((((.(((((((((((....)))).....))))))).))))))))))))).)))))).))))))).)).... (-39.5)