mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCCCATAATGTAAGA TTACATTATGGAACGGAGGGA TGCAACTACTCCCTCCGTCCCATAATGTAAGACGTTTTTTCACACGTACACTAGTGTCAAANAACGTCTTACATTATGGAACGGAGGGAGTATTATC GATTTTACACACATAATGGCACACCACATACAAGGCTAAATTACATGCAACTACTCCCTCCGTCCCATAATGTAAGACGTTTTTTCACACGTACACTAGTGTCAAANAACGTCTTACATTATGGAACGGAGGGAGTATTATCTTACTGCANGGNAGAGGCNAGCTAGCTTCTCGAAGCCTCTTGATAAGGGTATCCAGAGATTTCTTCTTTGGATTCTGCCTANCACCNNTAGTTCNAGATGTTGAGANATAGCTCNCTGNGGTATCCCTGAACTTCTCCGAGATAATTGCCACCTTTNTATAATCAGANCTTATTGTAGCTCTTCTCACGGATCACTGGGNTNNGGAAGTTCTCTGGGNTGNTGCTCATNNNAAGATTCNCCANCTGCCTCGGCTCCACCAGCTGCAGACTTCAGTTTCACTTGCTGCANAATGCTGATGAGAGGC 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 2e-21 tae-MIR1130 0.00000002 -53.4 ......((((((((((((.(((((((((((((((((.(((.((((........)))).))).))))))))))))))))).))))))))))))..... (-53.4)