mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTGTAAACTAATATAAGAG CTTATATTAGTTCACGGAGGG CCATATACTCCCTCTGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGATCACTAAAATAGTAATCTAAACACTCTTATATTAGTTCACGGAGGGAGTACCAT ATATTTGCATTNCTGTGAAACGTATAATGGTTAAGGGTTTCACCACGCAATCTCCAGTTACAGAAGAGACGCAATACTATATGATACTAGAAAAGAAATATCTGTGAGCAAGTCAACCGCACGTCAACCCATCAGACCATGACAAGCAGCCATATACTCCCTCTGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGATCACTAAAATAGTAATCTAAACACTCTTATATTAGTTCACGGAGGGAGTACCATTTACAAGAAACTAACTACATTAGTGGCTGACATCAGAGCCATCATCCACTGCTTTTCCAGCGCCTCCACCGCATGACTTTGCGACTGACTCAAACAGCTGCTTAATCTCGGGTGCGCAGTGTGTGAAGGCTCGGTTCCAAAAGTTGTAGCGCGGGTTCTTTATCAGCTCGATGAAGGTGATGAGTAATCCCCAGGGGTGAGGACGATTCACTATCAGCCGTTCTAAGAGAACCCTCGTCACCTGCTCCTGGATATGTTCCTGGCTAGCTTCAGCAAATAGATACAGAATGATGAAGGAGAAGTAGTGCGTGTGGCTATTCGGGTAGCGCAGTTGGTTTGCAATCGCATTCAAAAACAGGTGGCGCCCCTCTGTATCCAAGTTCGTTACAAGATATCTGAAAAATTCAGTCGCAGTTTCGATCTGAAAAATATCCATTGTACTATGGTTAATCTGCTGTGCTGACGCAGATGCATTTGCCTTGTTCGCTTGCAGTTGTTGCACCGCTTGGATGCCAATGTAGAGAACAAGCGAATTCATCAG 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 1e-34 tae-MIR1121 2e-17 -48.6 .....((((((((((((.((((((((((((((.((((((((.((((...)))).)))))))).)))))))))))))).)))))))))))).... (-48.6)