mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCTGTAAACTAATATAAGAG CTTATATTAATTTACGGAGGG TCGTGTGCTGTATTATACTCCATCTGTAAACTAATATAAGAGCATTTAGATCACTACTTTAGTGATCTAAACACTCTTATATTAATTTACGGAGGGAGTAGTTGCAAAAGTAGT GGCGTTCGACGCGAGTCAAATGTCTTGTCAGCATCGTCCAAGGTCGCCGACGATGGCAAGCTCTACTACGAAGTCGAGGTGAACATCAAGTCCTACGCAAGCAACAATGAGCTAGCGGTGATGCCGAAAGACAGGGTGCAGAGCCTGGAGTGGGACCGGCGGTACCTGACAGTCCTCGGCGTCGAGAACAATCAGCTGTACGCGCTACGGCTGCAGACGCCGGAACGGTTGCTCTCGGAGGAAGAGGGAGACCTGAGGAGAGTCATGGACTCCTTCAGGGTCAACAAGATACAAGCGTAGTGCTAAAATGTGCGGCAGCAGCGAGCAATGTTTTGCCCAGTGGAGATAACAGAATTTTGTATAGCCGACGCCATTCTTTATTCCCTGACACTATCGTTTAATTTTCCTTGGCTTGTAAAAGAGCCTACATGTACCTCGTGTGCTGTATTATACTCCATCTGTAAACTAATATAAGAGCATTTAGATCACTACTTTAGTGATCTAAACACTCTTATATTAATTTACGGAGGGAGTAGTTGCAAAAGTAGTGTCAAAAAACATCACGCATAAAAATACGGAGTATGCAACATCGAGATGAAATTTGAAAGTTTTCTGAGGCAGAGATTTCTCAAGGTAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 5e-28 tae-MIR1121 4e-19 -46 ........((((...((((((.((((((((.(((((((((((..((((((((((((...))))))))))))..))))))))))).)))))))).))))))..))))........ (-46)