mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTAAACTAATATAAGAG CTTATATTAGTTTACAGAGGG TCATCTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGAATACTAAAATAGAGATCTAAACGCTCTTATATTAGTTTACAGAGGGAGTACTTT CAGTTTTGACATGGCCCCCTCTTATTTTCTATGCACAATGACTAGTCTAATCGCGGAGTTGTGACACACAAGTACAGGATAGTAGGCTCTATAATTTCTGATTTCGCTTCGCTGCTGCAGAACACATTCATACATCCATAGCCAATACCTTTTCAGGCTCAACAGGAGTGTTAACCATCTCTGACAAAGAACCGTAGACTCGAATTGGAGCTACCCTGCGTTCCGAGTCCTGGACTCTACGCGGTGTGCTCGTGGTTGCTCCTCCTATCAAAATATGCCGCCAAGTGCTAGTCCTGGCTGGTCTCGGTTTTAAACAAGGATTATGTCAGGAGTATTTGTTGATTGAAAGTAGCGCCTTCCAAATTTATCTTCACTTTGTATCAAAAAGAAACAGGATATCAAGTACCACCAAACAAGGATTATCTAAGGAGTCTTTTAGTCAGCCCTTGAGCTGCTGCAGCTACCATATAGCCAGATTCCTGATCAGCTCAACCAGACTTCTGTTACCACAGGTCTGATTCAAGCTGGCCCTGGTTTGAAAGAGAAGCTACATTTTTGTAGAAGCACATCTGGTCAGAAATTTATCATCTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGAATACTAAAATAGAGATCTAAACGCTCTTATATTAGTTTACAGAGGGAGTACTTTCAACCACGAATGCACAAGATAAGACGTGTACTTCAACCGGCAACCACAAAGTAGAAGGCAGCATACTTCCAAAAAACAAGGGTTGTCANATTTGAAGAAACCTCATAATGAAANCAATAAATAAACAAAGGAAATGAAG 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 3e-41 tae-MIR1121 0.0000000000003 -48.1 .....(((((((((.(((((((((((((((((((((((((...((.......)).))))))))))))))))))))))))).))))))))).... (-48.1)