mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTAAACTAATATAAGAG CTTATATTAGTTTACAGAGGA TAATGTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGATTACTATTTTAGTTATCTAGACACTCTTATATTAGTTTACAGAGGAAGTACTCT CTGCTCGAGAGATTCTGAGAGAGATAAAGACAGTTTTGGAACTCTCCAAGAAAATGAGGCTTGATCTCGGTGTCTCTTCTGAATCCATGAAACCGTCAGAGAAGCCTTTAGCTGGAGCTGTGAAGGACGAGCCCACAGAGCCAGTTCCATCTGGAGAAAGAAATCAAGTTCCTCCGACAGGTCAGCCTGCAGTTCCTCCTAATATTGCAAATGATGGTGCACCGGCCACCCAAGCCTGATAAGTGATAACTCAGCGAGTGCAGCAGAGAAAATACCAGAGGGGAAGGGAACCCTAAGCAGTGAGATGGCAAATCACCCAAAGCACCTCGTGAAAACAGTGCAAGGGTCTTATGTGGTTGGTGGATCTCCTGTTGGCTGGAATTTTCTTGTTTGGCTTGGTGGTAAAATAATGTATTATGGGGTTGCCAAAGAGGTGTTTCGGACGCGCCAAGCTGCAAATTGAGATGTTCCCTTCAAATTGAAACTTTCTGATTTGTAATGTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGATTACTATTTTAGTTATCTAGACACTCTTATATTAGTTTACAGAGGAAGTACTCTTTAAATTGATGGGAGTTACTACCTCCGTTCTGGTTTAAAAAAAAAA 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 7e-30 tae-MIR1121 5e-18 -43.8 ....(((((.((((.(((((((((((((((((.((((((((.((((...)))).)))))))).))))))))))))))))).)))).)))))... (-43.8)