mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTGTAAACTAATATAANAG TTTATATTAGTTTACAGAGGG CATACAGATACATTATACTCCCTCTGTAAACTAATATAANAGCGTTTAGATCACTAAAATAATAATCTAAACACTTTTATATTAGTTTACAGAGGGAGTACTTGTATTACT ACTACTTCGTGCAGATCCTGGGGAAGAGCGTGNACCANCTGTGGAACGACTACAAGGCCAAGTACCCCCAGCCCCAGGGCTGATCGACGATGCATGCAGTTTGTTGTTGTATGTGTACCGGTCTTCGTCTACATACAGATACATTATACTCCCTCTGTAAACTAATATAANAGCGTTTAGATCACTAAAATAATAATCTAAACACTTTTATATTAGTTTACAGAGGGAGTACTTGTATTACT 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 5e-28 tae-MIR1121 0.00000000002 -47.9 ......((((((...((((((((((((((((((((((((.((.((((((((.............)))))))).)).))))))))))))))))))))))))..))))))... (-47.9)