mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTGTAAACTAATATAAAAG CTTATATTAGTTTACGGAGGG ATCTAGAATAAGTACTACTCTCTCTGTAAACTAATATAAAAGTGTTTAGAACACTAAAATAGTGATCTAAACGCTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTACTATGTAGTATTAT AACCTGGAGGGTGGNTACCTCTCCTTGCTCAAGAGCGCAAGCTACCCGCANCCGGCAGCCAGCCACCACTGATCCATCAATTCCGTATCTAGAATAAGTACTACTCTCTCTGTAAACTAATATAAAAGTGTTTAGAACACTAAAATAGTGATCTAAACGCTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTACTATGTAGTATTATCCAACATCCTATGAGTTATGAAGAATAAGAGGAAGAAGCGTGTTCAGAACTGAGGAATTAATTTCCATGGAAAAAGAAGGCACTATGCATGTATATGCATCCTGAGTTTTGGCATGGACTTTGTTCNACCAAAAGTGCTACTAGCTGA 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 2e-30 tae-MIR1121 3e-20 -51.8 ......((((.(((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((.(((((...))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))....)))).. (-51.8)