mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAAATCATCCTTGGCTAT TAGCCCAGGGTGACTTGCCCAT GGTAGGATGAATGAAATGAGCATGGGTCTGGCATGGGGTGTGGTAAGAGGTACTTCGGGTAGCCCAGGGTGACTTGCCCATGGAACCGCCGGACGCCGCTCTCTGTGGCAGAGAGCTCGGCTGCCAAGGGAGTTTCACAGGCAAATCATCCTTGGCTATCGAAGATGGCCTCTTACCCCCATCCAAGACCTCGCTCACCCTGTGTCCAAAAAAAA TCGGCACGAGGCCGACACCGTGTCCTGAGTTGGGGCTGCAAGCTCACTGATTCTCAGAAATACAGAAAAGGAAAGAGAAGGGAGAAGATGATCCAGTCAACTGGCTAAAGGCATAAAAGGAATGCTAGGGATAAATGTCGGGGAGGGAGGCTGAGGGGGTTGCCACTGATTACTGTGGCAGGGTGGCAGCAAATGTCCATGCTGCTGGGGCTCGATAGCGCCACAATGGCAGGCCAGGCGCGGAGGTAACCACTGGAATGTTTTGTTTGCATGTATGTTTGCAAGCATGTATGTCTTGTATGTAAGGTAAGGGGCTTACCTGATGATGATCGCCGGTCCTTGGGTGAATTCTGTTCAGCACTAGGTAGGATGAATGAAATGAGCATGGGTCTGGCATGGGGTGTGGTAAGAGGTACTTCGGGTAGCCCAGGGTGACTTGCCCATGGAACCGCCGGACGCCGCTCTCTGTGGCAGAGAGCTCGGCTGCCAAGGGAGTTTCACAGGCAAATCATCCTTGGCTATCGAAGATGGCCTCTTACCCCCATCCAAGACCTCGCTCACCCTGTGTCCAAAAAAAAAA 3 1 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR169_5 0.00000000000001 tae-MIR1433 7e-81 -93.9 ....(((((.......(((((..((((((((.((((((....(((((((((.((((((.(((((.(((((((.(((((..((((((..((((..(((((((((((...))))))))..)))..))...)).))))))..))))).))))))).)))))))))))...))))))))))))))))).)))))).))))).....)))))........ (-93.9)