mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGAGCAAATTTACTTTGGA TCAAGTTACTTTTTGTTTAGCAT CTCTTACTTCAGCTGAGCAAATTTACTTTGGAGTTGGGCATTAGAATGGACTTTCATGGCAAAACCAGTGAGGAAGGTGCTGCTTTTCAAAGCTTTCATATTTTTGGGGCAATTCATCTGGTTGTACAGAGCTGATAAGTGAATCATTTAGTCCCACAAATTGAATGTTGTATATTCATTATTATTAGAAACAAATTCTCCTACAGGCCATTTCAAGCAAAATAGATACAGTACATCAAAGCTCTCTCTCCCTCTGCAAATTCAAAGTTGATTTTTATTTCTCAAGTTACTTTTTGTTTAGCATTAGTCGTT GAGGACTCTTGGTGTTCTATCTCTGATGAAAAGGATAAAGATGTTTCATCTCAGTGTAAGATAAAGCTACCACTGGCATACCATTGGCCCAGTTTGGAAAAAGTTGCAACTTTTGATAGGAGTTGCTTAGATTCAAAAGCTGCTTTTTTAATTTTAACACCAAGCACGAGTTCAGAAAAGGATGAGAATCAGAGTATATATATCTGGGTAGGAAGATCTTTTGATGAGAGCTTGCTTCATAGCAATGGATTAATGAAGGAGGGAACTCATGTTGACTGGAATCAAGCTGGTTGTCATGTTCTAACTCAAGTGGGTCTTCCAAGGGATATCTCTGTTAGGATTATTAAAGAAGATGAAGAGCCAGAGGATTTTCTTGCAATTTTGAGTGCATTGTAGCTCATCATGGTCAAGGAAGGTTCTGCAGCTCCTTAGCTTAAATCTTCTTTCTCTTACTTCAGCTGAGCAAATTTACTTTGGAGTTGGGCATTAGAATGGACTTTCATGGCAAAACCAGTGAGGAAGGTGCTGCTTTTCAAAGCTTTCATATTTTTGGGGCAATTCATCTGGTTGTACAGAGCTGATAAGTGAATCATTTAGTCCCACAAATTGAATGTTGTATATTCATTATTATTAGAAACAAATTCTCCTACAGGCCATTTCAAGCAAAATAGATACAGTACATCAAAGCTCTCTCTCCCTCTGCAAATTCAAAGTTGATTTTTATTTCTCAAGTTACTTTTTGTTTAGCATTAGTCGTTAATTGTTCTATGGTTTTCGCTGCACATGCCATATC 4 2 5' arm Euphorbia_esula mirnest 100 100 -53.5 ...........((((((((((...((((.((((.((((.(((((..((((.((.(.(((.....)))..((((.(((.(((((((....)))).((((.((((.((((((...(((((((......))))..)))((((((...)))))))))))).))))))))((.((((((((.(((.((.((.((((.....(((.....)))...)))).)).))))).))))...)))).)).)))....))).)))).).)).))))...))))).)))).)))).)))).....)))))))))).......... (-53.5)