mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCATAATAT ATTATGGGACGGGGGGTGTAG CCGGGCATGGACTCCTGCATCTCTAAAACTTCAGCATGGCCTCCAACGCGCGAAGAACGTCGTCGCGGGTAACTATACCTGTTAGCAGTGTTTAGAATATCCTGTTAAGCTTGAAAACATAATCCAAACAATAGTTGATGTTAAGGGGATGATACAGATCTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTTGACATTACATTAGTGTAAAAAACGCTCTTATATTATGGGACGGGGGGTGTAGNATAGATNAGTCCTNTNCTGATGNACTANTGNTGGGATCANGTANTCANGCATNACAGGATAGTCTAGNCACNGCANACNGGNATAGNGCATCGCGACGACGTANCNTCGCGCGNTGGNGGNCATGCCGNNGNTTTATNAGATGAGGAGNNGATGNCN ATACGGGTACATAACAGACCAGAAGCTTCCGGGCGTGCTTCTTTACAAGGAAAAGCTCTCCTAAAAGTTCCCAGGCTTATTTTTGCGATACAGGCTACAACACTTTTACAGACTATAGATCTGCCTGCTACTCAAAAGCACCGCGGACACACATATTTACAGATCCACAAGTACCGGGCATGGACTCCTGCATCTCTAAAACTTCAGCATGGCCTCCAACGCGCGAAGAACGTCGTCGCGGGTAACTATACCTGTTAGCAGTGTTTAGAATATCCTGTTAAGCTTGAAAACATAATCCAAACAATAGTTGATGTTAAGGGGATGATACAGATCTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTTGACATTACATTAGTGTAAAAAACGCTCTTATATTATGGGACGGGGGGTGTAGNATAGATNAGTCCTNTNCTGATGNACTANTGNTGGGATCANGTANTCANGCATNACAGGATAGTCTAGNCACNGCANACNGGNATAGNGCATCGCGACGACGTANCNTCGCGCGNTGGNGGNCATGCCGNNGNTTTATNAGATGAGGAGNNGATGNCNGGNNNTGGNGGNNCNGCNNNNATGTGCGNCNGNGGNGCNTNTGAGNNCCNGGCNGANNNNNNNNNNGNNANNGNGNNNNNNCCNGNNNNNNNNCNNNNNGNCNNNNNNNNNNNCNGNGNGNNNNNNNNG 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 5e-28 hvu-MIR1120 0.000000000006 -169.1 (((....))).(((((.(((((.((((......(((((.((.(((.(((((((...((((((((((((((..((((.((.((..((.(((.(((((.((((((((...((.(((..((....((((..((.((((..((....(((((((.((....(.((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((...)))))).)))))))))))))))))))))))))))))).))))..)..))..)))))...)).))..)))).)).)))).....))..))).))...)))))))).))))).))).))..)).)).)))).)).))))))))))))....))))))).))).)).)))))......))))..))))))))))......... (-169.1)