mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCATAGTAT ATTATGGGATGGGATGAGTG CTCAAACACATACTCCCTCCGTCCCATAGTATAAGACGTTTTTGCAAGCTATATTAGCTTTAGAAAACCTCTTATATTATGGGATGGGATGAGTG GGACAAAAGCTAGATGGACACTTATTTGCGGACGCACGAAGTATATACATGCCTAAAAACCTCAGTGCTTGCCTATAGTCTTTTTCAGTGATGACAGTAAAATTAGCGCGCACTCAAACACATACTCCCTCCGTCCCATAGTATAAGACGTTTTTGCAAGCTATATTAGCTTTAGAAAACCTCTTATATTATGGGATGGGATGAGTG 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.00000000000002 tae-MIR1130 0.000004 -41.2 ..........(((((..(((((((((((((((((((.((((((..((((((...))))))..)))))).)))))))))))))))))))..))))) (-41.2)