mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGATACATCAGTATCTAGAC CTAGATACGGAGGTATCTAGC TGTGATATAGCTACGTACTTCCCCCGTTCCGAATTACTTGTCTTAGATTTGTCTAGATACGGAGGTATCTAGCACTAAAATGAGTCTAGATACATCAGTATCTAGACAAATTCAAGACAAGTAATTCGGAACGGAGGGAGTACATGACATAACGGA TTTATTCTTCATTACAATTAAAAGCATATATTGTGAACGGGCGAGTGCGCGAGCTATACGACGTCGCCATCCCAACGCCACTCGGTCCTCTGCCCAAACTATGTCGTCATGACCACGCTTTGATCGTGCCATCCCACGACGCTGTCACCACGGCCTTCAACCATGCATGTGATATAGCTACGTACTTCCCCCGTTCCGAATTACTTGTCTTAGATTTGTCTAGATACGGAGGTATCTAGCACTAAAATGAGTCTAGATACATCAGTATCTAGACAAATTCAAGACAAGTAATTCGGAACGGAGGGAGTACATGACATAACGGAAAAAAAAAACTGGCCAAGACATGAACAACCTCACGCTACGTGGACAGCTTATTCTTGTGAAAATTAAGCCAAGTAGAANTTGACGTGTGCAACGAGATTAAGTCTACAAGATAGACCCCCCAGGAAGTGGATGAAGAACAAACTATTGCTGAACAAGGACCTTCTGGCTCGGATGATCTGGCAAAGCTGCAACGCAACGGAGTAACTGTTAGCTGCAATCAAAGAAGATGCGTGCGTACGTGCAGGAAGCATTAGCTTGTGCCGGGTTANNGGGCTACCTGGGTGAACGGAGGCTAAACGGCAGGAGCAGCCGGAGAGCACTGTGCAGGCTGCTCGGTTACAGCTTTAGGCCTACGTGGTGGATCACCAACTTTGTGTTTAACATCTTCGGAGATCCCCCTGGGAGGCTTGACAGGTACATGTACAGGTGCAGGTTCAGGTGTGCCACAGGAACCATTGGTTACAGCACCGCGATGCGTCCTAGGTGGTGGATCATGAATAGGGTGTCTAGGAATTTCGTGTCCAGGACCTTCANANATGTCCCGGGGAGGCTTGACAGGTACAGTTTCAGGGGTGCCACGTGAACCATTGGTTACGGCGCCNCGACNCGTCCTAGGT 2 0 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 3e-52 tae-MIR1122 0.000000008 -79.9 .((......))...((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.((.((((((((.(((......))))))))))).)).))))))))))))))).))))))))))))))))))))).))))))))............. (-79.9)