mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAG AACCCCATGGAAAGGGTAGGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGATTTTGCAGGGTAAATCAAGCTGCTGATCTATGGATTCCACAGTCCTAACCCTAATTAATTATGGGGATAGGCTTGCGGCTTGCATATGTTAGGAGCTTTATTACCTCTTTGTTTTATCTTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACTTTTCTCTCTCTAGATT AGTTCCAGTTCTTTTCCTATTTATTTATTTAGATCTGATTTTTAGGTGTTTTATTAGATTAGATCAAACAACTAACACTAAATAGGAATTACTGTTCTAATAGTATTAATATTCTTAATTAGTTGTATTTTTGCTTATAAATTCCTAATTAAACACCAATAGTATCCTATATATACTGGTCCATAGGGTTCATTATTCAACAGATTCGTTCCAAAAAAAATTTCTGAGGTCTCTTCAGTTCTGTATAAATTTATTTTTTTCCTCGTAGTTTTTGGGTTATGATCTGGTTAATATAGGGTTTTATTTATGTAACCCCATGGAAAGGGTAGGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGATTTTGCAGGGTAAATCAAGCTGCTGATCTATGGATTCCACAGTCCTAACCCTAATTAATTATGGGGATAGGCTTGCGGCTTGCATATGTTAGGAGCTTTATTACCTCTTTGTTTTATCTTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACTTTTCTCTCTCTAGATTCTCTATTTGTTTTGAATTTCTGGGTTCTAATTTGTTCTGTTCAGTTCAGATCTTTATGGTTTATCAATTCTGGATCTATTTGCAAGAAAAACGTAAATTCTGGGTGTATTTTGGAATTTCCCAATATGTTGTTTTTATTTTTTTTGC 2 0 3' arm Euphorbia_esula mirnest MIR159 0.00000000000001 csi-MIR159 8e-16 -76.2 .......((((.((((.(((((((((((((((..((((((((.((((((...(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.((((.(((((........))))).)))).))).))....)))).))))).)))))..))))))...)))...)))))).))))))))..)))))))))))).)))..)))).)))).... (-76.2)