mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAG AACCCCATGGAAAGGGTAGGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGATTTTGCAGGGTAAATCAAGCTGCTGATCTATGGATTCCACAGTCCTAACCCTAATTAATTATGGGGATAGGCTTGCGGCTTGCATATGTTAGGAGCTTTATTACCTCTTTGTTTTATCTTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACTTTTCTCTCTCTAGATT AGTTCCAGTTCTTTTCCTATTTATTTATTTAGATCTGATTTTTAGGTGTTTTATTAGATTAGATCAAACAACTAACACTAAATAGGAATTACTGTTCTAATAGTATTAATATTCTTAATTAGTTGTATTTTTGCTTATAAATTCCTAATTAAACACCAATAGTATCCTATATATACTGGTCCATAGGGTTCATTATTCAACAGATTCGTTCCAAAAAAAATTTCTGAGGTCTCTTCAGTTCTGTATAAATTTATTTTTTTCCTCGTAGTTTTTGGGTTATGATCTGGTTAATATAGGGTTTTATTTATGTAACCCCATGGAAAGGGTAGGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGATTTTGCAGGGTAAATCAAGCTGCTGATCTATGGATTCCACAGTCCTAACCCTAATTAATTATGGGGATAGGCTTGCGGCTTGCATATGTTAGGAGCTTTATTACCTCTTTGTTTTATCTTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACTTTTCTCTCTCTAGATTCTCTATTTGTTTTGAATTTCTGGGTTCTAATTTGTTCTGTTCAGTTCAGATCTTTATGGTTTATCAATTCTGGATCTATTTGCAAGAAAAACGTAAATTCTGGGTGTATTTTGGAATTTCCCAATATGTTGTTTTTATTTTTTTTGC 2 0 3' arm Euphorbia_esula mirnest MIR159 1.0E-14 csi-MIR159 8.0E-16 -76.2 .......((((.((((.(((((((((((((((..((((((((.((((((...(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.((((.(((((........))))).)))).))).))....)))).))))).)))))..))))))...)))...)))))).))))))))..)))))))))))).)))..)))).)))).... (-76.2)