mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGGAACGGAGGGAGTAAA TACTCCCTTTGTTCCAAAATA TAAATACATAAATACTCCCTTTGTTCCAAAATATTTGTCTTAAATTTCAACAAGGGACTATTTACAATCCAAAATATGTCTATATACATCCGTATGGGGGAGCCCATTTGAAATCTTTAAAAAAACAAATTTTTTGGAACGGAGGGAGTAAATACCATCAG GCAACACCAAACCATTATTTTCACCAACCCAGAATGCATGGAAATAAATACATAAATACTCCCTTTGTTCCAAAATATTTGTCTTAAATTTCAACAAGGGACTATTTACAATCCAAAATATGTCTATATACATCCGTATGGGGGAGCCCATTTGAAATCTTTAAAAAAACAAATTTTTTGGAACGGAGGGAGTAAATACCATCAGGCATGCCATGCAAGGTTCAAACACTTAACTCGATTATCCACCCAAGTCCAAGTTTAGCTACCTACCAAATCATCCAAGGTTCAGGTTGGTTTAACAACCCCAACACAAACACAAACGATAACTTGCCTTGCCGCACATCCATGGTATGGTTCCCAACGCAACAAACCGACTTACTTGTTCATTTTACGGGCACCCATACAGCTACAGTTCAAGGGGCCATCTAAATACATAAATAGGTTTTATACAAACACACGGTTCAACCT 2 0 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.000002 tae-MIR1122 0.0000001 -44.3 ............(((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((...(((..(((((........)))))..(((.(((((....)))))..))).)))..))))))..)))))....)))))).)))))))))))))))))))........... (-44.3)