mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TATTGGTGCGGTTCAATCGGA GAAAAAATAACCAAAATACGAGATATTGGTGCGGTTCAATCGGAGAACTTTGCTCTTTGTTTAGAGAGCTATGTTGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTATGAATTAAAATTTAT GTTTGCTTCTTCTCTTCTTCCTCCATTCTGTGCTCTCTTGCTCATTCGAAATTAAGAGAGATCGGTTCGATTCGATCAAGTTCTTTCTTTATCGTAGTTTATGTCACTCCTAGTTCTATGTATTTTTTTCTCCCCTAGGAGGAAAAATAACAAAATTATGAGATGCGGGTGTGGTTCGGTTCGATCAAGTTGTTTCTTTATCCTAGTTCATGTTATTTCTAGTTTGGTATATTTCTACGAGAAAACAAAATACCAGATATGGGTGCATTTTTGTTTGATCAAGCTGTTGTTTTTTTATATATATATCTTAGTTTACATATTTGTTACTAGTTCGATATATTTATATTCTCATGGGAGAAAAAATAACCAAAATACGAGATATTGGTGCGGTTCAATCGGAGAACTTTGCTCTTTGTTTAGAGAGCTATGTTGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTATGAATTAAAATTTATTTCTTTCTCTCTTTTGTTATCATTTATTCTTAATTTTCTTTTGCTGAAATTTTTATATCTATATATTTGTACAAATTTTGATTTCAATTTGTTCTCAGTAAATGCTAAAACAATATGAATATTCTATTGTATACGTTTAATTAACTCGGTTTTGTGTTTCCTCCTTAGGGACATTATCAACAACATTAGCCTTGCCGGGTTTATACTCAAGCTTATAGTCAAATTTAGCTAGAAAATCTCCTCAGCAGGTTTGTTTCTGTTTGAATTTCTTTGGAGTTTTAGAGTAGCTCGTGGCCACATTATCGATCATGAT 0 0 3' arm Euphorbia_esula mirnest MIR171_1 1e-16 rco-MIR171b 7e-18 -48.1 ...............(((((.(((((((((((((((((((((((.(((...(((((((....)))))))...))).))))))))))))))))))))))).))))).............. (-48.1)