mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGAGGATAGGGAGGAGGAC CCTTCTAATCTTATTTAGCT ATGACGATGAGGTTGAGGATAGGGAGGAGGACGAGGAAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGGGGATGAAGAAGAAGCCCTGCAGCCACCATAGAAGAGGAAGAAATGAAATACGAAACTAGTATTGTGTTTCTAAATGCTTTTAACTATGGATTTTATGTTAGGTCTATGACCTTCTAATCTTATTTAGCT CAGGTGTTGGCCGTACAGATGGAGATGGTGGTGGTTAACCAGGTTTTGCTAACGTGCGCCGGGGAGACTCTTGCTACTCTATTAACTTCCGTAATTTTTGCTAATAAAGCCCTGCTTTATTCATCTCAGGACATTATGGGCCAGAAGAAATTGATTGATGCTGAGGAAGCAGATGGCAATGAGGATAACGACGACGATAACAGTAATGACTTCGGAGAAGGTGAAGAGGAGCTGTCGTCAGAAGAAGGGGAAGGACATGGCAACAATCCCAACAATGGAAATACCAAGGGCGGACCCGGAGGAGGTGCCGGTGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGGAAGGGGAAGACAAAGAGGATGAAAATGGCCACAACGATGATGACAACCACGATGAAGATGGTGAGGACGACGACGACGACAATGATGACGATGAGGTTGAGGATAGGGAGGAGGACGAGGAAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGGGGATGAAGAAGAAGCCCTGCAGCCACCATAGAAGAGGAAGAAATGAAATACGAAACTAGTATTGTGTTTCTAAATGCTTTTAACTATGGATTTTATGTTAGGTCTATGACCTTCTAATCTTATTTAGCT 4 2 5' arm Actinidia_chinensis mirnest 100 100 -41.1 ..........(((((((...(((.((((((.((.(((((((...((((.((....((((.............))))....)).((((((.(((((.(((((((.(((((.......))))).))))))).....)))))..)))))).)))).))))...))).)).))))))..)))..))))))) (-41.1)