mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCCTTAAATA TTTTGGGACGGATGGAGTATT TTATGTTCCTTTTCTCGTAATTTTAACTAACTACTCCCTCCGTCCTTAAATAAGTGTTATTTTGGGACGGATGGAGTATTACTTCGGCAAATGAGGTTCTGGACTCTG CCACGCGTCCGGGGAATAGGAGAATCATCATCATTGTAAAACTGTAACTTGTAACCATGTAGTGTCAAAAAACGTCTTATATTATGGGACAAAGGGAGTATATATTTTATGAGAGGCCTGAATGCCTGCTACGATTGTTGAAGTGCCCATTTCAATCAGGATTTATGTTCCTTTTCTCGTAATTTTAACTAACTACTCCCTCCGTCCTTAAATAAGTGTTATTTTGGGACGGATGGAGTATTACTTCGGCAAATGAGGTTCTGGACTCTGAAACGCCTGAAGCCTGATACGAATGTCGATTGCCCATTTCAAACAGGATGTATGTTCCTTGTCTCGTAATTTTAATTAACAATTACTTCAACAAATGAGGTTCTGGACTCTGAAACGCCCACTTTACTTTGACATTCCCACATGATGTATATGTAACATTTTCTTCTAATGCCTGATTTGCAGGAAGGATCCAAATTACAAAAGGATGGTAATGGCATGCTTCATTCNNNNAGTCTACCTTCTTGAAATAGACAGACAAGACCAGAAAGGAGAAGAGATTGGCCTTGCTCCAAAATGGTGGAAGCCCTTCAAGTACAAGGTCACACAGACACTGGTGGACGAGNNNNNTGGC 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.00002 far-MIR437 0.0003 -33.3 ......(((...((((((...((.((.(((.((((((.((((((((.((((((...)))))).)))))))).))))))))).)).))...))))))....)))..... (-33.3)