mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCCG GGCAGTCTCCTTGGCTATG TGTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCCTAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATTATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGGCTCCATCTCTTCTG AAGAAAGAGTCTCATCCTGTCAAAAAAAAAAANNNNNTAAAAAAAAAGATGAAAGAAAGAGTTGTGTTTGGAAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGCTCCTATACTTACCCCTAATTTGGGTTGTAATTAAGGAAATACAGGCAGTCATCTTTGGCTAATTTGACACACTCTTCTTTGTCATGTTAGACACTTTGTCTTCTTTAATTAATATATATAGTTATAGTTTAGTTTAGTAAGGCATTAATGTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCCTAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATTATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGGCTCCATCTCTTCTGTTAATAATTCTTTATTTTTTTTTTATCTATGTCTTGTCTTTTACATGGTCAAATTTTTTTCTATCCAATTTCCGTTTACTTTGTTTTGAAGGATTTGAAGATAAAGAGGAAGATANNNCAAGGAAGATATATAAATGGACTTTACACATTGTGGTTGTCAATGCAAATTTACCAATGGGTA 0 2 5' arm Euphorbia_esula mirnest MIR169_5 0.00000000008 ptc-MIR169v 0.00000000007 -108.6 .....(((((((.((((((((..(((((((.(((((((.(((..(((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((((.(((((....))))).)))...(((.((((..((.((((((..((((((.((........)).))))))..)))))).))..)))).)))(((((((((...))))..)))))))))))))....((((((.((((......)))).))).))).......)))))...))))))))))))))))))))...)))))))))))))).)))..))))))))...))))))).. (-108.6)