mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAGTCTCCTTGGCTATGCT GGTAGCCAAGGATGACTTGCCCG GTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCCTAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATTATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGGCTCCATCTCTTCT AAGAAAGAGTCTCATCCTGTCAAAAAAAAAAANNNNNTAAAAAAAAAGATGAAAGAAAGAGTTGTGTTTGGAAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGCTCCTATACTTACCCCTAATTTGGGTTGTAATTAAGGAAATACAGGCAGTCATCTTTGGCTAATTTGACACACTCTTCTTTGTCATGTTAGACACTTTGTCTTCTTTAATTAATATATATAGTTATAGTTTAGTTTAGTAAGGCATTAATGTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCCTAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATTATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGGCTCCATCTCTTCTGTTAATAATTCTTTATTTTTTTTTTATCTATGTCTTGTCTTTTACATGGTCAAATTTTTTTCTATCCAATTTCCGTTTACTTTGTTTTGAAGGATTTGAAGATAAAGAGGAAGATANNNCAAGGAAGATATATAAATGGACTTTACACATTGTGGTTGTCAATGCAAATTTACCAATGGGTA 3 2 3' arm Euphorbia_esula mirnest MIR169_5 0.00000000008 ptc-MIR169v 0.00000000007 -108.6 ....(((((((.((((((((..(((((((.(((((((.(((..(((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((((.(((((....))))).)))...(((.((((..((.((((((..((((((.((........)).))))))..)))))).))..)))).)))(((((((((...))))..)))))))))))))....((((((.((((......)))).))).))).......)))))...))))))))))))))))))))...)))))))))))))).)))..))))))))...))))))). (-108.6)