mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAAGTTTGACTTAAGACAAA TGTCTTAAGTCAAACCTTCAA AGACATGCTCCCTCTGTTTATTTTTACTCCGCACATTAGGTTTGTCTTAAGTCAAACCTTCAAAAGTTTGGCCAAGTTTCTGCTAAAAAATACCAACATTCACAATATCAAATAAATACACTAACATAAATTTGGTCAGACTATGGGAAGTTTGACTTAAGACAAACCTAATATGTGGAGTGAAAAGGAACAGCATGAGTACTTC AGGGTNATNTNAGACCGGCCGCCCTTTTTTTTTTTTTTAACAAGTGATAGATCATCCAAGTAATAATTCGTTAATAGGTGCGTACGGGTGTCAGCATTCATATACAATTCCAGAGTTTGAACCTTTACTCCTCAGTCAGATAAGACATGCTCCCTCTGTTTATTTTTACTCCGCACATTAGGTTTGTCTTAAGTCAAACCTTCAAAAGTTTGGCCAAGTTTCTGCTAAAAAATACCAACATTCACAATATCAAATAAATACACTAACATAAATTTGGTCAGACTATGGGAAGTTTGACTTAAGACAAACCTAATATGTGGAGTGAAAAGGAACAGCATGAGTACTTCACTGTTTTTGCTTGTTCATCCAAGACTATCATCTTTTTCTTCTGCATGTGCCTCTGTCATCCACCAGGCAAAACCACTCACAATCACAGGGCCTAAACAACAGCCCCCCATAAAATGTATGCAGTCCATAATTCTTTGTGATCTTGAATGCAAACGCCAGTAAGGGTCATTGGGTTTAGGCTTGACTAGTACAGAAAGATGACGCGCCAGCCGACCATTTTGCCGGACTATCTTGCCACTAACGTTGTAGCTCCTTTCAAGGCCAGAAATCATATTGTACAGCTCCTCTTTCTTCCCATCGATTTGCACTAGGCGGCTTGCAACATCTTTTTGTTGCTCAGCTGTGAGGCCATTCGTGTTGATGAGCCGTGGCAGGAACCCGCTGTGATCCTCTGCCGCAGTCGATGAGATGCCGAACCCCTGTGGTCTTCGGAGCGTGAATCGACCAAGTGTCCTCGCCGGATATTGAAGTTGCACCATCCCTGATTTTGGTTTCTCTTGAACCTAGCGGTGGNCTGCCTATGCACCGGGCGGGGGGCCTTTATGTGTGGGACCGGGCGGCTGCTCCAGGGAAGGGAGGCCCTGCTGGGATCCTATACCGGCCCGGGGGCGGAGGGCCGGCAAAAATTGGCGGGGGTTAGGAAACCCTAACA 1 0 3' arm Triticum_aestivum mirnest 100 bdi-MIR437 0.0002 -78.604 .....(((((...((((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((...(((((((((((((((.((.((....................................)).)).)))))))))))))))...))).))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))...))))).... (-78.604)