mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCTGTAAAGAAATATAA ATATTTCTTTACGGAGGGAGT CAAATAAGTATTCCCTCTGTAAAGAAATATAAGAGTGTTTAGATCACTAAAGAAGTAATTTAAACGCTCTTATATTTCTTTACGGAGGGAGTACTGATCA TAATTGGATCCAAATCAGGAAACTACAAGTATCTCGGAACGACATGGTTCATGGTCACAATGGAGTACAAATAAGTATTCCCTCTGTAAAGAAATATAAGAGTGTTTAGATCACTAAAGAAGTAATTTAAACGCTCTTATATTTCTTTACGGAGGGAGTACTGATCACTACAATAAGCACATGACTTGTATTGAATACTGAAGCCAGGTACTCAAGGACGACGTTCCACCTTGATCACAG 0 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 3e-23 tae-MIR1121 4e-31 -54.4 ......((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.....))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..... (-54.4)