mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTATGTGTGCTCACTCTCTA GAGAGTGAGCACCCATGGTCT TGAAATGATAAGGGTACAGGGCGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCATGGTCTTTTCCTGCATATATCATTTTATGCTCGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCCCCGCCTCTCTCTCTCTCTC AAGGCATATGCACAGATGATGAAATGATAAGGGTACAGGGCGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCATGGTCTTTTCCTGCATATATCATTTTATGCTCGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCCCCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGATTAGTTGTTATTGATGATTTGATCCATCTTACTCACATGCATATATCCTTTCTTTCTTTATAATCTTATTAATTAGCTTGGGATATCAGAGATCTGATCTCATCTCATCTTATTCTCTTGCGTTTCATTATTCACATTTAAAAAAATCTCTCTTTAGATCATCGATCGGTTAAAGTATATTATTATAATCAATGATCATAAAAAGTCTTATTATGGTTTGCATAGTTTAATCATAATAATGATACTCCCTCCAATAACAAACAATTAGTCGCTAGGAGTATTTGTTTTCATCATATATATATATATCTATCTAGAGTAGTAATTGGTTACATTAAATTATATATGTTTTTGTGAGAGAAGCATGGAACATTCTTGTTTCTGGTCCTGCTACAAGGAGACATGACTATTTTTCTTCAAACACAATTTTACATGCTTTATTTATATTTATTATGTATAG 2 0 3' arm Euphorbia_esula mirnest mir-156 0.0000000000005 aly-MIR156f 7e-18 -56.7 ..........((((....(((.((((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((........)))))..))))))))).))))))))))))).))))))))))))....))))......... (-56.7)