mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCCCATAATGTAAGA TTACATTATGGGACAGAGGGC GGTTACTACTCCCTCCGTCCCATAATGTAAGACGTTTCTTGACATCAGTGTACGTCTTACATTATGGGACAGAGGGCATACTTAA CCACGCGTCCGCCTGGGTTGAGGGAAGCTGGGTGGACTCCTGACCAGTGGGGGCATTCCAAATCACGTTCAACATTTTCCTCGGATTACAACACTTACAGACAGCAGCTTACTAGCCTTATGCGGATGTTGTTGAAGAGTTTGGTCGATCATGCCGATGCTTGGCCATTCAAAGAGCCGGTGGATTCACGTGATGTTCCAGATTATTATGATATTATCAAAGACCCTATTGATTTGAAGACAATGTCCAGAAGAGTCGAGTCGGAGCAGTATTATGTGACCTTAGAGATGTTTGTAGCCGACTTAAAGAGAATGTTCATTAATGCGAGAACCTACAACTCTCCTGATACGATCTATTTCAAATGCTCCACACGGCTCGAGGCCTACTTCACAAATAGAATCCAATCTCACATTGCCCAGGCTGCGTCAACCAAGAACTAGACTGATGTTGGGCGCATTGGTAGTCACTTGTTATGCCGTCCAGCAATTTTTTACTATTGATGCAGCATCATCTCACGATTTTACTTGGTCAACGTTCAAAATTATCACTCTTTAGGCTCATGGAATACTAGTTGTCCGAGAGAAGCTAATGTTGTTGCACATGAATTAGCCAAAATAGCTGGATCCTCGTTTTGTGAGGAGTGGACTGAAGATGCTCCTAATGAGCTACTTCCTCTATTGATCAAAGGTGTAAACCTGGTTACTACTCCCTCCGTCCCATAATGTAAGACGTTTCTTGACATCAGTGTACGTCTTACATTATGGGACAGAGGGCATACTTAATAGAGAGGAAGTAAAGTTATCC 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.00000000002 tae-MIR1130 0.0000003 -38.1 (((.......(((((.(((((((((((((((((((...(((....)))...))))))))))))))))))).)))))...)))... (-38.1)